Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2310003L06RikQ9CV82 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
2310003L06RikQ9CV82 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2310003L06RikQ9CV82 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2310003L06RikQ9CV82 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2310003L06RikQ9CV82 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms