Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930553M12RikQ9CUH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930553M12RikQ9CUH1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930553M12RikQ9CUH1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms