Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a2Q9CTG6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a2Q9CTG6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a2Q9CTG6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a2Q9CTG6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp13a2Q9CTG6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms