Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdpd1Q9CRY7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdpd1Q9CRY7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdpd1Q9CRY7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdpd1Q9CRY7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Gdpd1Q9CRY7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd1Q9CRY7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdpd1Q9CRY7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms