Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC8

Lrrc40, Leucine-rich repeat-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc40Q9CRC8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc40Q9CRC8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc40Q9CRC8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc40Q9CRC8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc40Q9CRC8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms