Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ska2Q9CR46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ska2Q9CR46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ska2Q9CR46 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ska2Q9CR46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ska2Q9CR46 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ska2Q9CR46 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ska2Q9CR46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms