Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd2aQ9CQJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd2aQ9CQJ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Higd2aQ9CQJ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Higd2aQ9CQJ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms