Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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