Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lyrm1Q9CQB7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lyrm1Q9CQB7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lyrm1Q9CQB7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lyrm1Q9CQB7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lyrm1Q9CQB7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lyrm1Q9CQB7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lyrm1Q9CQB7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lyrm1Q9CQB7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lyrm1Q9CQB7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lyrm1Q9CQB7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms