Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700029P11RikQ9CQ68 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700029P11RikQ9CQ68 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029P11RikQ9CQ68 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms