Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NenfQ9CQ45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NenfQ9CQ45 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NenfQ9CQ45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NenfQ9CQ45 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NenfQ9CQ45 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NenfQ9CQ45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms