Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms