Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox6cQ9CPQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6cQ9CPQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cox6cQ9CPQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox6cQ9CPQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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