Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt23Q99PS0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Krt23Q99PS0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Krt23Q99PS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt23Q99PS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt23Q99PS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt23Q99PS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms