Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rrbp1Q99PL5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rrbp1Q99PL5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rrbp1Q99PL5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Rrbp1Q99PL5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rrbp1Q99PL5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rrbp1Q99PL5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rrbp1Q99PL5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rrbp1Q99PL5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rrbp1Q99PL5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms