Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc4Q99PH1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc4Q99PH1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc4Q99PH1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc4Q99PH1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc4Q99PH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc4Q99PH1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms