Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tsnaxip1Q99P25 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tsnaxip1Q99P25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsnaxip1Q99P25 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsnaxip1Q99P25 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms