Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cep41Q99NF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cep41Q99NF3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cep41Q99NF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cep41Q99NF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cep41Q99NF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms