Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bco2Q99NF1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bco2Q99NF1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bco2Q99NF1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bco2Q99NF1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bco2Q99NF1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bco2Q99NF1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bco2Q99NF1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bco2Q99NF1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bco2Q99NF1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Bco2Q99NF1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bco2Q99NF1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Bco2Q99NF1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bco2Q99NF1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms