Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b1Q99NB9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b1Q99NB9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b1Q99NB9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b1Q99NB9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b1Q99NB9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b1Q99NB9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms