Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl1Q99N96 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl1Q99N96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl1Q99N96 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl1Q99N96 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl1Q99N96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl1Q99N96 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl1Q99N96 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl1Q99N96 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl1Q99N96 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms