Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lysmd3Q99LE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lysmd3Q99LE3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lysmd3Q99LE3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lysmd3Q99LE3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lysmd3Q99LE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lysmd3Q99LE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lysmd3Q99LE3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lysmd3Q99LE3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lysmd3Q99LE3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lysmd3Q99LE3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lysmd3Q99LE3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms