Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsl24d1Q99L28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsl24d1Q99L28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsl24d1Q99L28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsl24d1Q99L28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsl24d1Q99L28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsl24d1Q99L28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms