Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dok4Q99KE3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dok4Q99KE3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dok4Q99KE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dok4Q99KE3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dok4Q99KE3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dok4Q99KE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dok4Q99KE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dok4Q99KE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dok4Q99KE3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Dok4Q99KE3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dok4Q99KE3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dok4Q99KE3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dok4Q99KE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.9 ms