Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX4

Eif3m, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3mQ99JX4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3mQ99JX4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3mQ99JX4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3mQ99JX4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3mQ99JX4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3mQ99JX4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3mQ99JX4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3mQ99JX4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3mQ99JX4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eif3mQ99JX4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Eif3mQ99JX4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3mQ99JX4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3mQ99JX4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3mQ99JX4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3mQ99JX4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3mQ99JX4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3mQ99JX4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3mQ99JX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms