Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddb2Q99J79 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddb2Q99J79 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddb2Q99J79 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ddb2Q99J79 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms