Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan1Q99J59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tspan1Q99J59 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan1Q99J59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan1Q99J59 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan1Q99J59 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan1Q99J59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms