Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubb6Q922F4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tubb6Q922F4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubb6Q922F4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubb6Q922F4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubb6Q922F4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tubb6Q922F4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms