Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI6

Papd4, Poly(A) RNA polymerase GLD2, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd4Q91YI6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Papd4Q91YI6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Papd4Q91YI6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Papd4Q91YI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Papd4Q91YI6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Papd4Q91YI6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Papd4Q91YI6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Papd4Q91YI6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Papd4Q91YI6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Papd4Q91YI6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Papd4Q91YI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Papd4Q91YI6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd4Q91YI6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd4Q91YI6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd4Q91YI6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms