Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha1Q91Y21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha1Q91Y21 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdha1Q91Y21 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha1Q91Y21 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha1Q91Y21 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha1Q91Y21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha1Q91Y21 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms