Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pcdha12Q91Y18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcdha12Q91Y18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcdha12Q91Y18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdha12Q91Y18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcdha12Q91Y18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdha12Q91Y18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcdha12Q91Y18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdha12Q91Y18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms