Protein–RNA interactions for Protein: Q91WV7

Slc3a1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc3a1Q91WV7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc3a1Q91WV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc3a1Q91WV7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc3a1Q91WV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc3a1Q91WV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc3a1Q91WV7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc3a1Q91WV7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms