Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usb1Q91W78 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usb1Q91W78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usb1Q91W78 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usb1Q91W78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usb1Q91W78 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usb1Q91W78 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usb1Q91W78 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms