Protein–RNA interactions for Protein: Q91VX2

Ubap2, Ubiquitin-associated protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap2Q91VX2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubap2Q91VX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubap2Q91VX2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubap2Q91VX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubap2Q91VX2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubap2Q91VX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubap2Q91VX2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubap2Q91VX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubap2Q91VX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubap2Q91VX2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubap2Q91VX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.4 ms