Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI75

Ipo4, Importin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo4Q8VI75 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ipo4Q8VI75 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ipo4Q8VI75 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ipo4Q8VI75 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ipo4Q8VI75 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ipo4Q8VI75 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ipo4Q8VI75 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ipo4Q8VI75 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ipo4Q8VI75 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ipo4Q8VI75 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ipo4Q8VI75 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ipo4Q8VI75 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ipo4Q8VI75 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms