Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc65Q8VHI7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc65Q8VHI7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc65Q8VHI7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc65Q8VHI7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc65Q8VHI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc65Q8VHI7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc65Q8VHI7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms