Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smg8Q8VE18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smg8Q8VE18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg8Q8VE18 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg8Q8VE18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg8Q8VE18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smg8Q8VE18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg8Q8VE18 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smg8Q8VE18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg8Q8VE18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smg8Q8VE18 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smg8Q8VE18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smg8Q8VE18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg8Q8VE18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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