Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SdsQ8VBT2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SdsQ8VBT2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SdsQ8VBT2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SdsQ8VBT2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SdsQ8VBT2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SdsQ8VBT2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 673.7 ms