Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TxlnbQ8VBT1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TxlnbQ8VBT1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TxlnbQ8VBT1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TxlnbQ8VBT1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TxlnbQ8VBT1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms