Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc16Q8R349 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc16Q8R349 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc16Q8R349 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdc16Q8R349 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdc16Q8R349 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc16Q8R349 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc16Q8R349 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc16Q8R349 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc16Q8R349 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc16Q8R349 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc16Q8R349 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc16Q8R349 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc16Q8R349 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms