Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D1

Vmn1r22, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r22Q8R2D1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r22Q8R2D1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r22Q8R2D1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r22Q8R2D1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r22Q8R2D1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r22Q8R2D1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vmn1r22Q8R2D1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r22Q8R2D1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r22Q8R2D1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r22Q8R2D1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r22Q8R2D1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r22Q8R2D1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms