Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q7

Cerk, Ceramide kinase, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerkQ8K4Q7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CerkQ8K4Q7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CerkQ8K4Q7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CerkQ8K4Q7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CerkQ8K4Q7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CerkQ8K4Q7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CerkQ8K4Q7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CerkQ8K4Q7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CerkQ8K4Q7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CerkQ8K4Q7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CerkQ8K4Q7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CerkQ8K4Q7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CerkQ8K4Q7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms