Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pitrm1Q8K411 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitrm1Q8K411 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitrm1Q8K411 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pitrm1Q8K411 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pitrm1Q8K411 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitrm1Q8K411 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pitrm1Q8K411 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pitrm1Q8K411 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pitrm1Q8K411 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitrm1Q8K411 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms