Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1eQ8K202 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1eQ8K202 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1eQ8K202 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1eQ8K202 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1eQ8K202 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1eQ8K202 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1eQ8K202 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1eQ8K202 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1eQ8K202 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1eQ8K202 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms