Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pnma3Q8JZW8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pnma3Q8JZW8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pnma3Q8JZW8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pnma3Q8JZW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnma3Q8JZW8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms