Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc4a8Q8JZR6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc4a8Q8JZR6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc4a8Q8JZR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc4a8Q8JZR6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc4a8Q8JZR6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc4a8Q8JZR6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slc4a8Q8JZR6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc4a8Q8JZR6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms