Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1bQ8JZL7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rasgef1bQ8JZL7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Rasgef1bQ8JZL7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rasgef1bQ8JZL7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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