Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf628Q8CJ78 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf628Q8CJ78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Znf628Q8CJ78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf628Q8CJ78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf628Q8CJ78 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf628Q8CJ78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms