Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mterf1aQ8CHZ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mterf1aQ8CHZ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mterf1aQ8CHZ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms