Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phc3Q8CHP6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phc3Q8CHP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phc3Q8CHP6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phc3Q8CHP6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phc3Q8CHP6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phc3Q8CHP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Phc3Q8CHP6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phc3Q8CHP6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phc3Q8CHP6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phc3Q8CHP6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phc3Q8CHP6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phc3Q8CHP6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms